以下是安徽二本大学排名2016具体榜单，根据理科二本录取平均分排名，包含部分专业在二本招生的一本大学。
| 安徽二本大学排名 | 学校名称 | 录取线差 | 省市分数线 | 录取平均分 |
| 1 | 蚌埠医学院 | 46 | 511(第二批) | 557 |
| 2 | 皖南医学院 | 37 | 511(第二批) | 548 |
| 3 | 安徽工程大学 | 36 | 511(第二批) | 547 |
| 4 | 合肥学院 | 35 | 511(第二批) | 546 |
| 5 | 安徽理工大学 | 31 | 511(第二批) | 542 |
| 6 | 铜陵学院 | 28 | 511(第二批) | 539 |
| 7 | 合肥师范学院 | 28 | 511(第二批) | 539 |
| 8 | 安庆师范学院 | 24 | 511(第二批) | 535 |
| 9 | 安徽中医药大学 | 22 | 511(第二批) | 533 |
| 10 | 黄山学院 | 21 | 511(第二批) | 532 |
| 11 | 淮北师范大学 | 19 | 511(第二批) | 530 |
| 12 | 皖西学院 | 14 | 511(第二批) | 525 |
| 13 | 阜阳师范学院 | 14 | 511(第二批) | 525 |
| 14 | 蚌埠学院 | 12 | 511(第二批) | 523 |
| 15 | 滁州学院 | 9 | 511(第二批) | 520 |
| 16 | 安徽科技学院 | 9 | 511(第二批) | 520 |
| 17 | 池州学院 | 6 | 511(第二批) | 517 |
| 18 | 巢湖学院 | 6 | 511(第二批) | 517 |
| 19 | 淮南师范学院 | 5 | 511(第二批) | 516 |
| 20 | 宿州学院 | 3 | 511(第二批) | 514 |
