学生在校学习期间，有下列情况之一的，可以转专业：
（一）学生确有特长，转专业、转学更能发挥其特长的； 这种情况一般要求你大一第一学期绩点高，成绩好。学校会有转专业机会，需要面试。
（二）学生入学后发现某种疾病或生理缺陷，经学校指定的医疗单位诊断确认，不能在原专业学习，但尚能在本校或其他高等学校相关专业学习的；
（三）经学校认可，学生确有某种特殊困难，不转专业或不转学则无法继续学习的；
（四）本科学生学习确有困难，要求转入专科学习的；
（五）根据就业形势和社会对人才需求情况，学校认为确实有必要调整少量学生专业的。
吉林医药学院所有的专业一览表
| 院系名称 | 本科专业 | 学制 |
| 马克思主义学院 | 应用心理学 | 四年 |
| 基础医学院 | 医学影像学 | 五年 |
| 预防医学 | 五年 | |
| 药学院 | 药学（临床药学方向） | 五年 |
| 药物制剂 | 四年 | |
| 医药营销 | 四年 | |
| 护理学院 | 护理学 | 四年 |
| 护理学（英语护理方向） | 四年 | |
| 公共卫生学院 | 预防医学（营养与食品卫生方向） | 四年 |
| 生物医学工程 | 四年 | |
| 公共事业管理（卫生事业管理方向） | 四年 | |
| 食品质量与安全 | 四年 | |
| 信息管理与信息系统 | 四年 | |
| 管理学院 | 公共事业管理 | 四年 |
| 市场营销 | 四年 | |
| 检验学院 | 医学检验 | 四年 |
| 医学检验（临床输血方向） | 四年 | |
| 生物技术 | 四年 | |
| 生物医学工程学院 | 生物医学工程 | 四年 |
| 学信息工程 | 四年 | |
| 应用心理学院 | —— | —— |
