主要区别包括，一是滁州学院是全日制本科院校，是教育部批准设置的，是正厅级单位。滁州职业技术学院是全日制高职院校，是安徽省人民政府批准设立的，是副厅级单位。
二是滁州学院是省属高校，滁州职业技术学院是滁州市管理的高职学校等等
