徐州医科大学有硕士点，徐州医科大学现共有8个硕士点。
以下为徐州医科大学2023年研究生招生专业及院系
学科代码 专业名称 招生院系
85409 生物医学工程 医学信息与工程学院
86001 生物技术与工程 药学院
105101 内科学 第一临床医学院
105101 内科学 附属连云港医院（连云港市第一人民医院）
105101 内科学 附属淮安医院（淮安市第二人民医院）
105101 内科学 第二附属医院（徐州矿务集团总医院）
105101 内科学 附属徐州市立医院（徐州市第一人民医院）
105101 内科学 盐城临床学院（盐城市第一人民医院）
105101 内科学 江阴临床学院（江阴市人民医院）
105101 内科学 徐州临床学院（徐州市中心医院）
105101 内科学 淮安临床学院（淮安市第一人民医院）
105102 儿科学 第一临床医学院
105102 儿科学 附属连云港医院（连云港市第一人民医院）
105102 儿科学 徐州临床学院（徐州市中心医院）
105103 老年医学 第一临床医学院
105103 老年医学 附属淮安医院（淮安市第二人民医院）
105103 老年医学 淮安临床学院（淮安市第一人民医院）
105104 神经病学 第一临床医学院
105104 神经病学 附属连云港医院（连云港市第一人民医院）
105104 神经病学 附属淮安医院（淮安市第二人民医院）
105104 神经病学 第二附属医院（徐州矿务集团总医院）
105104 神经病学 附属徐州市立医院（徐州市第一人民医院）
105104 神经病学 盐城临床学院（盐城市第一人民医院）
105104 神经病学 徐州临床学院（徐州市中心医院）
105104 神经病学 淮安临床学院（淮安市第一人民医院）
