南通大学好。
1.地理位置，南通大学在南通，位于上海苏州无锡旁边本身也是江苏第四gdp城市，南通也只有南通大学一所一本学校。江科大，处于镇江，南京常州旁边，但是镇江有江苏大学，镇江南通谁好谁差我也不好说。
2.经费，南通大学今年经费过20亿，江科大今年经费过10亿，但是考虑到南通大学综合类院校，差距不是那么大。
3.学科实力，南通大学的医学还是很出名的，四个医学类博士点在江苏很不错。江科大在船舶行业很不错，但是医学应该稍强传统工科。
4.两个学校普通专业录取分数差不多，南通大学稍高点，但是医学类肯定高不少。报考我推荐南通大学，因为上大学这也是一种投资，南通大学潜力更大，城市发展，学校发展，专业发展等等，这都是需要考虑的
