二者都是中国顶尖的高等学府，具有很高的学术水平和声誉。在选择哪个学校的强基计划更好时，需要考虑多个因素，包括学科评估、师资力量、科研成果、录取分数线等。
学科评估：
复旦大学拥有5门A+学科，13门A-学科，6门A学科。
上海交通大学拥有6门A+学科，8门A-学科，11门A学科。
从学科评估来看，上海交通大学在某些方面表现更为突出，但整体差距不大，都有望在短期内赶上来。
师资力量和科研成果：
上海交通大学拥有57个硕士点，45个博士点，35名院士，22个重点实验室。
复旦大学拥有43个硕士点，37个博士点，29名院士，26个重点实验室。
在国家级特色专业方面，复旦大学有15门，而上海交通大学未具体提及。
录取分数线：
在某些地区，如贵州，复旦大学的录取分数线普遍高于上海交通大学。
在上海地区，考生更倾向于选择复旦大学，因为两者相差不大，但复旦大学的录取人数更多，考生被录取的可能性也更大。
强基计划吸引力：
上海交通大学的强基专业明显比复旦的更吸引人。
综上所述，两所学校在学科评估、师资力量、科研成果等方面各有优势。复旦大学在录取分数线和考生选择方面可能更有优势，尤其是在上海地区。而上海交通大学在某些学科评估和强基计划方面表现更为突出。因此，哪个学校的强基计划更好取决于个人对专业、地理位置、录取机会等因素的偏好。建议考生根据自己的兴趣、职业规划和考试成绩来选择最适合自己的学校。
