浙江农林大学共有5个校区，分别是杭州校区、临安校区、湖州校区、衢州校区和舟山校区。杭州校区设置有农学院、林学院、动物科学技术学院、人文社会科学学院、食品与生物工程学院等17个学院。
临安校区设置有园艺学院、植物保护学院、环境与资源学院、信息工程学院等9个学院。
湖州校区设置有生态设计艺术学院、旅游与环境学院等4个学院。
衢州校区设置有机电工程学院、生命科学学院、机械与电子工程学院、人文与艺术学院、外国语学院等6个学院。
舟山校区设置有海洋学院、生命科学与技术学院等2个学院。共有70多个本科专业、80多个硕士专业、40多个博士专业，涵盖农林、生态、生物、环境、信息等综合性学科范围。
