南京理工大学举办有两所独立院校（三本），两所院校的收费标准略有不同，具体如下：南京理工大学紫金学院收费项目及标准：
1.学费：人文社科类专业14000元/学年，理工类专业15000元/学年，计算机科学与技术（嵌入式培养）、通信工程(嵌入式培养)17000元/学年；
2.住宿费：1500元/人·年；南京理工大学泰州科技学院收费标准：
1. 学费：人文社科类专业14000元/人·年，理工科类专业15000元/人·年，嵌入式培养专业17000元/人·年，艺术类专业16500元/人·年。
2. 住宿费：1400元/人·年。
