根据2021年西南医科大学招生章程所显示，目前该校专科专业只有一个，就是临床医学专业。
另外，其余本专科招生专业如下：
（一）专业类招生本科专业
1.药学类：包含药学、临床药学专业。
2.公共管理类：包含公共事业管理、劳动与社会保障、市场营销专业。
3.体育学类：包含社会体育指导与管理、休闲体育专业。
按专业类招生录取的学生专业分流时间为进校学习第一学年结束时。专业分流选择范围为所在专业类下包含的各专业。
（二）非专业类招生本科专业
基础医学、临床医学、麻醉学、儿科学、医学检验技术、医学影像学、医学影像技术、口腔医学、眼视光学、康复治疗学、中医学、中西医临床医学、中药学、预防医学、护理学、法学、食品卫生与营养学、卫生检验与检疫、生物医学工程、信息管理与信息系统、运动康复、应用心理学、英语、健康服务与管理专业。
（三）专科专业
临床医学专业。
