东南大学和西南交通大学。
按照教育部学位与研究生教育发展中心最新给出的学科评估结果，“交通运输工程”学科最好的大学有两个：东南大学和西南交通大学，成绩同为A+，在52所参评的高校中，并列第一名。
"交通工程如果是铁路系统那么德累斯顿工业大学在这方面是德国非常不错的学校，这个方向在德国也是非常强势的，但是这个专业目前还是德国传统的本硕连读专业，原来专业相关的只能申请高年级插班。其次还有达姆斯达特工业大学、亚琛工业大学、布伦瑞克工业大学等都是有交通相关专业的。"
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