根据国家规定，学生入学须交纳学费、住宿费、书本费及各种证件（卡）工本费等费用。下文是福建医科大学各专业学费收费标准详情，供参考查阅！
| 大学 | 专业 | 学费（每年） | 年份 | 学制 |
| 福建医科大学 | 社会工作 | 5000 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 食品质量与安全 | 5000 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 应用心理学 | 5000 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 英语 | 5000 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 公共事业管理 | 5460 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 生物信息学 | 5460 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 生物制药 | 6200 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 康复治疗学 | 6240 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 卫生检验与检疫 | 6240 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 眼视光学 | 6240 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 医学检验技术 | 6240 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 医学影像技术 | 6240 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 护理学 | 6760 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 临床医学 | 6760 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 药物制剂 | 6760 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 药学 | 6760 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 助产学 | 6760 | 2019 | 4 |
| 福建医科大学 | 基础医学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 口腔医学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 临床药学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 临床医学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 麻醉学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 医学影像学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 预防医学 | 6760 | 2019 | 5 |
| 福建医科大学 | 临床医学 | 6760 | 2019 | 8 |
学校先后设有国家奖学金、国家励志奖学金、优秀奖学金、以及“协和奖学金”、“教育发展基金助学金”、“沈云英奖学金”、“联邦医学教育奖学金”、“姚薛奖学金”、“少数民族学生奖学金”等多项社会奖学金。其中“姚薛奖学金”、“沈云英奖学金”是由优秀校友设立的。同时学院另配套有相应的奖学金，如“单科奖学金、学业进步奖学金”等。
