西南大学生物技术学院 前身为西南农学院蚕桑系。其历史可以追溯到上个世纪三、四十年代。上个世纪三、四十年代，西南地区的四川大学、云南大学、原中央技艺专科学校等大专院校分别设立了蚕桑系或蚕丝科。
1952年全国范围的院系调整，将上述三所大专院校的蚕学专业调整到西南农学院，合并成立蚕桑系；
1984年蚕桑系更名为蚕学系；
1986年由蚕学系的茧丝专业方向为基础另组建了丝绸工程系；
1992年，蚕学系和丝绸工程系合并为西南农业大学蚕桑丝绸学院，设蚕学、丝绸工程两个专业；
1992年蚕桑学实验室被批准为农业部重点实验室和重庆市重点实验室；
1998年国家专业目录调整，丝绸工程专业归入纺织工程，并增设服装专业；
2002年，四川畜牧兽医学院与西南农业大学合并成立新的西南农业大学，原西南农业大学蚕桑丝绸学院与原四川畜牧兽医学院生物技术系合并成立蚕学与生物技术学院、纺织服装学院，实行两块牌子，一套班子。在此期间，学院在蚕学研究领域取得了重大成就，该专业学科点被批准为国家级重点学科（特种经济动物饲养）；
2005年4月蚕学与生物技术学院独立建制运行；
2005年7月西南农业大学与西南师范大学合并组建西南大学；
2006年4月，学校进行学院设置和学科调整，将原西南农业大学蚕学与生物技术学院与原西南师范大学生命科学学院合并，组建西南大学生命科学学院、蚕学与生物技术学院，实行两块牌子，一套班子；
2007年4月，学校再次对学院进行调整，成立西南大学生物技术学院。
