南京财经大学的会计系和南京审计大学的会计系比南京财经大学的会计系的师资力量更深厚、专业级别更高，南京审计大学的会计系精品课程更齐全。
一、师资力量
1、南京财经大学的会计系：南京财经大学的会计系有专任教师72人。其中教授10人，副教授39人，讲师21人，助教2人。博士（含在读）22人。师资力量更深厚。
2、南京审计大学的会计系：南京审计大学的会计系有专任教师50人，兼职教师3人。专任教师中，有教授8人（占比16%），副教授24人（占比48%）。师资力量更缺乏。
二、精品课程
1、南京财经大学的会计系：南京财经大学的会计系有省级精品（优秀）课程18门。精品课程更缺失。
2、南京审计大学的会计系：南京审计大学的会计系有国家级精品课程15门、国家级双语示范课程6门。精品课程更齐全。
三、专业级别
1、南京财经大学的会计系：南京财经大学的会计系有江苏省品牌专业2个；江苏省特色专业6个。专业级别更高。
2、南京审计大学的会计系：南京审计大学的会计系有江苏省“十二五”重点专业5个。专业级别更低。
