二者各有各的特点，评价好与不好和个人的观点和角度不同，下面介绍一下二者的主要区别：
一、学校历史不同
1、江西财经大学
学校前身为1923年秋创办的江西省立商业学校，1958年成立江西财经学院，1980年成为财政部部属院校，1996年更名为江西财经大学，2000年学校管理体制由财政部主管转变为由江西省主管，2012年成为财政部、教育部、江西省人民政府共建高校。
2、南京财经大学
南京财经大学的前身是成立于1956年的粮食部南京粮食学校，1981年升格为南京粮食经济学院，1993年更名为南京经济学院。1999年，南京物资学校并入南京经济学院。2000年，江苏财经高等专科学校、江苏经济管理干部学院并入。2003年4月，经教育部批准，南京经济学院正式更名为南京财经大学。
二、学校规模不同
1、江西财经大学
截至2020年，学校有蛟桥园、麦庐园、枫林园、青山园四个校区。占地面积共2200余亩，建筑面积90余万平方米，设有16个教学学院，4个管理型学院，以及1个独立学院。
2、南京财经大学
截至2020年，学校拥有仙林、福建路和桥头3个校区，占地面积3005亩，校舍建筑面积95余万平方米，设有教学学院（部）18个，民办本科学院1个，拥有应用经济学博士后流动站1个。
三、院系设置不同
1、江西财经大学
学校设有共16个教学学院，4个管理型学院，以及1个独立学院。
2、南京财经大学
设有经济学院、国际经贸学院、金融学院、财政与税务学院、会计学院、工商管理学院等18个教学院系（部）。
四、学校特色不同
1、江西财经大学
省部共建高校（2012年）、中西部高校基础能力建设工程（一期）（2012年）、江西省一流学科建设高校（2017） 、省属重点本科高校。
2、南京财经大学
省属重点建设大学、省部共建。
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