1.仓库数量大，但布局不够合理。由于各行业各部门为了满足各自的需要，纷纷建立自己的仓库，导致仓库数量众多，他们都在经济集中地区和交通便利的地方建设仓库，以至于仓储布局极不合理，造成了部分地区仓储大量剩余和部分地区仓储能力不足的两极分化局面。
2.仓储技术发展不平衡，很多企业对提高仓库作业自动化、机械化的认识不足。一些大型企业的现代化仓库拥有非常先进的仓储设备，包括各种先进的装卸搬运设备、高层货架仓库等。而很多仓库作业仍旧靠人工操作。这种仓储技术方面发展的不平衡状态，严重地影响着我国仓储行业整体的运作效率。
3.仓储人才缺乏，仓储管理人才更不多。发展仓储行业，既需要掌握一定专业技术的人才，也需要善于操作的运用型人才，更需要仓储管理型人才，而我国目前这几方面的人才都很匮乏。据有关统计数据显示，2006年我国的物流人才缺口50万，仓储人才尤其是仓储管理型人才缺乏也很严重。
4.仓储管理方面的法制、法规不够健全。我国已经建立的仓储方面的规章制度，随着生产的发展和科学水平的提高，有些已经不适合实际情况。目前我国还没有一部完整的《仓库法》，仓储管理人员的法制观念不强，仓储内部的依法管理水平也比较低下，所以仓储企很难运用法律手段来维护企业的利益。
