公司股东变更债务仍然由公司来承担。因为公司是独立的企业法人，其以全部的财产对自身的债务承担责任。股东只在出资范围或认购的股份范围内对公司承担有限责任。公司股东变动的，原股东应将公司的真实状况告知新股东，并经双方确认后签订股权转让协议。变更后债权债务即由新股东在其出资范围内承担。
法律依据:
《中华人民共和国公司法》第三条公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
