船舶变更挂靠公司进行登记的，应当有当事人携带船舶登记的有关证明文件和变更证明文件，前往船籍港船舶登记机关办理变更登记。我国《船舶登记条例》规定，船舶变更船籍港时，船舶所有人应当持船舶国籍证书和变更证明文件，到原船籍港船舶登记机关申请办理船籍港变更登记。
法律依据:
《中华人民共和国船舶登记条例》第三十五条船舶登记项目发生变更时，船舶所有人应当持船舶登记的有关证明文件和变更证明文件，到船籍港船舶登记机关办理变更登记。
《中华人民共和国船舶登记条例》第三十六条船舶变更船籍港时，船舶所有人应当持船舶国籍证书和变更证明文件，到原船籍港船舶登记机关申请办理船籍港变更登记。对经审查符合本条例规定的，原船籍港船舶登记机关应当在船舶国籍证书签证栏内注明，并将船舶有关登记档案转交新船籍港船舶登记机关，船舶所有人再到新船籍港船舶登记机关办理登记。
