公司注销职工不同意补偿的，职工可以找工会进行投诉，工会有权对公司的行为提出意见或者要求纠正；劳动者还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。如果上述两种方式都不能解决纠纷的，则职工可以依法向法院起诉，通过诉讼的方式维护自己的合法权益。
法律依据:
《劳动合同法》第七十八条
工会依法维护劳动者的合法权益，对用人单位履行劳动合同、集体合同的情况进行监督。用人单位违反劳动法律、法规和劳动合同、集体合同的，工会有权提出意见或者要求纠正；劳动者申请仲裁、提起诉讼的，工会依法给予支持和帮助。
公司注销职工不同意补偿的，职工可以找工会进行投诉，工会有权对公司的行为提出意见或者要求纠正；劳动者还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。如果上述两种方式都不能解决纠纷的，则职工可以依法向法院起诉，通过诉讼的方式维护自己的合法权益。
《劳动合同法》第七十八条
工会依法维护劳动者的合法权益，对用人单位履行劳动合同、集体合同的情况进行监督。用人单位违反劳动法律、法规和劳动合同、集体合同的，工会有权提出意见或者要求纠正；劳动者申请仲裁、提起诉讼的，工会依法给予支持和帮助。
