公司停薪留职不合法。如果企业想要挽留员工，可以签订“劳动合同中止协议”，不用支付工资，从休假的第二年开始，可以按照最低基数缴纳社保，并约定由员工支付全部社保费用。
法律依据:
《《企业职工带薪年休假实施办法》》第五条职工新进用人单位且符合本办法第三条规定的，当年度年休假天数，按照在本单位剩余日历天数折算确定，折算后不足1整天的部分不享受年休假。
《《企业职工带薪年休假实施办法》》第四条年休假天数根据职工累计工作时间确定。职工在同一或者不同用人单位工作期间，以及依照法律、行政法规或者国务院规定视同工作期间，应当计为累计工作时间。
