个人独资企业的公司是不能分立的，因为其没有法人资格，只有一个企业主。企业主可以分别注册两个公司。注册个人独资企业需要提交申请书和经营场所的证明。
法律依据:
《中华人民共和国个人独资企业法》第九条申请设立个人独资企业，应当由投资人或者其委托的代理人向个人独资企业所在地的登记机关提交设立申请书、投资人身份证明、生产经营场所使用证明等文件。
《中华人民共和国个人独资企业法》第十条个人独资企业设立申请书应当载明下列事项：
（一）企业的名称和住所；
（二）投资人的姓名和居所；
（三）投资人的出资额和出资方式；
（四）经营范围。
