土地确权后，对土地所有权和使用权有争议的，处理方法如下：
1、当事人先行协商处理。
2、如果协商不成的，由人民政府处理。双方都是单位的，由县级以上人民政府处理；如果都是个人，或者一方是个人，一方是单位的，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
3、当事人对政府的处理决定不服的，可以在三十日内向人民法院提起诉讼。
4、在没有解决在土地所有权和使用权争议前，任何一方当事人都不得改变土地利用现状。
法律依据:
《中华人民共和国土地管理法》第十四条土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
