公司法人变更生效的时间是：公司登记机关核准变更之日。即发给营业执照之时。根据相关法律规定，公司登记事项变更涉及分公司登记事项变更的，应当自公司变更登记之日起30日内申请分公司变更登记。登记机关经审查，确认予以变更的，应当发给新的营业执照。
法律依据:
《中华人民共和国公司登记管理条例》第二十七条公司申请变更登记，应当向公司登记机关提交下列文件：
（一）公司法定代表人签署的变更登记申请书；
（二）依照《公司法》作出的变更决议或者决定；
（三）国家工商行政管理总局规定要求提交的其他文件。
《中华人民共和国公司登记管理条例》第三十五条公司登记事项变更涉及分公司登记事项变更的，应当自公司变更登记之日起30日内申请分公司变更登记。
