有债权债务纠纷的公司不可以注销，民法典中没有具体规定，但是根据我国公司法，对于公司注销，应当以公司的债权债务纠纷全部处理好为前提，公司破产清算结束才可以注销。
法律依据:
《《中华人民共和国公司法》》第一百八十八条【公司注销】公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
《《中华人民共和国公司法》》第一百八十七条【破产申请】清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。
公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。
