公司股权转让税费的计算方式是：
1、个人所得税应纳税额=（股权转让收入-本金（原值）-合理费用）x20%；
2、企业所得税应纳税额=（收入全额-财产净值）x25％；
3、印花税按产权转移书据所载金额的万分之五贴花。
法律依据:
《中华人民共和国企业所得税法》第六条企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。包括：
（一）销售货物收入；
（二）提供劳务收入；
（三）转让财产收入；
（四）股息、红利等权益性投资收益；
（五）利息收入；
（六）租金收入；
（七）特许权使用费收入；
（八）接受捐赠收入；
（九）其他收入。
