林权证上的土地被征用会有补偿，其补偿包括被征收林地的土地补偿费、安置补助费以及林木青苗和地上附着物补偿费。此外，征收部门还应向当地人民政府林业主管部门缴纳森林植被恢复费，用于恢复因征地而减少的林地植被面积。
法律依据:
《土地管理法》第二条
中华人民共和国实行土地的社会主义公有制，即全民所有制和劳动群众集体所有制。
全民所有，即国家所有土地的所有权由国务院代表国家行使。
任何单位和个人不得侵占、买卖或者以其他形式非法转让土地。土地使用权可以依法转让。
国家为了公共利益的需要，可以依法对土地实行征收或者征用并给予补偿。
国家依法实行国有土地有偿使用制度。但是，国家在法律规定的范围内划拨国有土地使用权的除外。
