土地使用税一般应当向土地所在地的税务机关缴纳。如果纳税人使用的土地属于不同地方的，应当分别向土地所在地的税务机关纳税，如果在同一省或自治区、直辖市管辖范围以内的，纳税人跨地区使用的土地，应当在当地省级地方税务局确定纳税地点缴纳。
法律依据:
《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第九条新征收的土地，依照下列规定缴纳土地使用税：
（一）征收的耕地，自批准征收之日起满1年时开始缴纳土地使用税；
（二）征收的非耕地，自批准征收次月起缴纳土地使用税。
《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第十条土地使用税由土地所在地的税务机关征收。土地管理机关应当向土地所在地的税务机关提供土地使用权属资料。
《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第十一条土地使用税的征收管理，依照《中华人民共和国税收征收管理法》及本条例的规定执行。
