该土地使用权纠纷的处理方式：
1、由发生土地使用权纠纷的双方当事人进行协商，根据协商的结果签订协议；
2、如果协商不成，可以申请人民政府处理；
3、对人民政府的处理决定不服的，可以向人民法院提起诉讼。
法律依据:
《土地管理法》第十四条
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
