对相关部门及房屋征收部门工作人员违法的处理：市、县级人民政府及房屋征收部门的工作人员违法的，由人民政府责令改正并通报批评，如造成损失的，应当依法承担赔偿责任；对于直接负责的主管人员以及其他直接责任人员，依法给予处分；如构成犯罪的，将依法追究刑事责任。
法律依据:
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第三十条市、县级人民政府及房屋征收部门的工作人员在房屋征收与补偿工作中不履行本条例规定的职责，或者滥用职权、玩忽职守、徇私舞弊的，由上级人民政府或者本级人民政府责令改正，通报批评；造成损失的，依法承担赔偿责任；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
