公司资不抵债进行清算破产有以下程序：
1、管理人拟订破产财产变价方案，适时变价出售破产财产；
2、破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照法定顺序清偿；
3、拟订破产财产分配方案，经人民法院裁定认可后，由管理人执行；
4、破产程序终结后，办理注销登记。
法律依据:
《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
