法院执行上市公司股权转让流程是：
1、人民法院判决或裁定以拍卖、变卖或其他方式转让给债权人或第三人；
2、工商行政管理机关协助执行，书面通知上市公司限期办理相关的手续。
法律依据:
《中华人民共和国证券法》第三十七条公开发行的证券，应当在依法设立的证券交易所上市交易或者在国务院批准的其他全国性证券交易场所交易。
非公开发行的证券，可以在证券交易所、国务院批准的其他全国性证券交易场所、按照国务院规定设立的区域性股权市场转让。
《中华人民共和国证券法》第三十八条证券在证券交易所上市交易，应当采用公开的集中交易方式或者国务院证券监督管理机构批准的其他方式。
《中华人民共和国证券法》第三十九条证券交易当事人买卖的证券可以采用纸面形式或者国务院证券监督管理机构规定的其他形式。
