公司变更登记有法律效力。有限责任公司和股份有限公司有关事项变更的，应当依法办理公司变更登记。申请人应当对申请文件、材料的真实性负责，未经变更登记，公司不得擅自改变登记事项。
法律依据:
《中华人民共和国公司登记管理条例》第二条有限责任公司和股份有限公司（以下统称公司）设立、变更、终止，应当依照本条例办理公司登记。申请办理公司登记，申请人应当对申请文件、材料的真实性负责。
《中华人民共和国公司登记管理条例》第二十六条公司变更登记事项，应当向原公司登记机关申请变更登记。未经变更登记，公司不得擅自改变登记事项。
