分公司股份协议是有效的。这是由公司的章程来决定，股东在董事会上对转让的股权进行说明，并半数通过，股东在私下进行签订的股权转让，我国的法律予以支持，股东没有说明则无效。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第一百五十三条违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
违背公序良俗的民事法律行为无效。
《中华人民共和国民法典》第一百五十四条行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。
《公司法》第一百四十一条第一款
发起人持有的本公司股份，自公司成立之日起一年内不得转让。公司公开发行股份前已发行的股份，自公司股票在证券交易所上市交易之日起一年内不得转让。
