对民间借贷纠纷中被告跑了的处理方式是，法院可以缺席判决；如果是必须出庭的被告，则法院可以在两次传唤后，拘传其到庭。对于法院作出的生效判决，即使被告未出庭的，也要履行。
法律依据:
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零九条人民法院对必须到庭的被告，经两次传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以拘传。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十四条被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十五条宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。 人民法院裁定不准许撤诉的，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以缺席判决。
