让损害公司利益的小股东退出的方式是：
1、与该小股东达成股权转让协议，购买其股份；
2、如果该小股东未履行出资义务的，经催告后仍不履行的，可以通过股东会或股东大会的决议解除其股东资格。
法律依据:
《中华人民共和国公司法》第七十一条有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。
让损害公司利益的小股东退出的方式是：
1、与该小股东达成股权转让协议，购买其股份；
2、如果该小股东未履行出资义务的，经催告后仍不履行的，可以通过股东会或股东大会的决议解除其股东资格。
《中华人民共和国公司法》第七十一条有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。
