工程承包合同纠纷可通过以下方式处理：
１、和解或调解。当事人可以自行协商和解，或者通过第三者进行调解。
２、仲裁。可以根据达成的仲裁协议，将合同争议提交仲裁机构仲裁。
３、诉讼。没有订立仲裁条款，也没有达成仲裁协议，或者达成的仲裁协议无效，合同的任何一方当事人都可向人民法院提起诉讼。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
（一）当事人的姓名或者名称和住所；
（二）标的；
（三）数量；
（四）质量；
（五）价款或者报酬；
（六）履行期限、地点和方式；
（七）违约责任；
（八）解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。
