农村宅基地房屋拆迁以宅基地使用权证书或国土部门测绘数据为基础赔偿。拆迁人可以按照被拆除房屋的重置成新价和宅基地的区位补偿价向被拆迁人支付补偿款，或者进行房屋安置，有条件的地区可以另行审批宅基地。
法律依据:
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十一条被征收人可以选择货币补偿，也可以选择房屋产权调换。被征收人选择房屋产权调换的，市、县级人民政府应当提供用于产权调换的房屋，并与被征收人计算、结清被征收房屋价值与用于产权调换房屋价值的差价。因旧城区改建征收个人住宅，被征收人选择在改建地段进行房屋产权调换的，作出房屋征收决定的市、县级人民政府应当提供改建地段或者就近地段的房屋。
