抵押了的不动产权证有房屋产权。办理抵押登记后不动产权证由业主自行保管，由贷款银行持他项权证。业主还清全部贷款终止抵押合同后需到房管部门办理撤消抵押登记，收回他项权证、重新颁发不动产权证，业主取得该房产的所有权利。
法律依据:
《城市房地产抵押管理办法》第三十四条以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的，登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后，由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。以预售商品房或者在建工程抵押的，登记机关应当在抵押合同上作记载。抵押的房地产在抵押期间竣工的，当事人应当在抵押人领取房地产权属证书后，重新办理房地产抵押登记。
