企业注销时还有存货可以选择将存货进行变卖或者拍卖等方式，获得价款，然后由清算组统一清理企业的其他财产之后，将款项的价额在编制资产负债表和财产清单时统一分配，在清算方案啊报股东会、股东大会或人民法院确认之后，按照清算方案处置。
法律依据:
《中华人民共和国公司法》第一百八十六条清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
