房屋他项权证办理流程如下：签订书面的房屋抵押合同，携带身份证件、房屋抵押合同、房屋所有权证书以及房屋抵押登记申请书到房屋所在地的房管局办理抵押登记，发放他项权证。
法律依据:
《《城市房地产抵押管理办法》》第三十四条以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的，登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后，由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。以预售商品房或者在建工程抵押的，登记机关应当在抵押合同上作记载。抵押的房地产在抵押期间竣工的，当事人应当在抵押人领取房地产权属证书后，重新办理房地产抵押登记。
