主合同无效，补充协议的效力视情况而定：主合同尚未生效，补充协议内容可独立履行的，补充协议有效；不能独立履行的，效力待定。双方在第一时间内签订的合同称之为主合同，而在其后双方以主合同为基础，另外协商而达成的协议称之为补充合同。如果主合同已经实际履行，主合同及补充协议均有效。主合同尚未生效，补充协议内容可独立履行的，补充协议有效；不能独立履行的，效力待定。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第五百四十三条当事人协商一致，可以变更合同。
《中华人民共和国民法典》第五百四十四条当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
