协商、仲裁或诉讼。公司与自然人之间有债权债务关系的，首先可以由双方自由协商解决，协商解决不成的，可以申请仲裁或诉讼到人民法院解决，判决生效后申请强制执行。
法律依据:
《公司法》第三条 公司界定及股东责任
公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
协商、仲裁或诉讼。公司与自然人之间有债权债务关系的，首先可以由双方自由协商解决，协商解决不成的，可以申请仲裁或诉讼到人民法院解决，判决生效后申请强制执行。
《公司法》第三条 公司界定及股东责任
公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
