二手房补充协议需注意的问题有：协议应详细写明需要补充的内容，同时需要明确主合同即二手房买卖合同的正文内容，或者采用将主合同作为附件的形式，最后交须由双方签字确认，署明日期。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第五百一十条合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
《中华人民共和国民法典》第五百四十三条当事人协商一致，可以变更合同。
《中华人民共和国民法典》第五百四十四条当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
