购房合同中的补充协议的注意事项：
1、确认开发商已经取得商品房预售许可证；
2、确认开发商制定的格式条款是否公平；
3、明确约定房屋交付条件和迟延交房的违约责任；
4、明确约定抵押权的处理方式。
法律依据:
《中华人民共和国民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
(一)当事人的姓名或者名称和住所；
(二)标的；
(三)数量；
(四)质量；
(五)价款或者报酬；
(六)履行期限、地点和方式；
(七)违约责任；
(八)解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。
