被扣车辆的保管费用应该由行政机关承担。因查封、扣押发生的保管费用由行政机关承担。因交通事故被扣押，交警大队委托停车场保管，在扣押期间的车辆保管费应当由交警大队承担，不应当由自己掏钱。
法律依据:
《中华人民共和国行政强制法》第二十六条
对查封、扣押的场所、设施或者财物，行政机关应当妥善保管，不得使用或者损毁；造成损失的，应当承担赔偿责任。
对查封的场所、设施或者财物，行政机关可以委托第三人保管，第三人不得损毁或者擅自转移、处置。因第三人的原因造成的损失，行政机关先行赔付后，有权向第三人追偿。
因查封、扣押发生的保管费用由行政机关承担。
