在系统上办理免检的流程为：
第一步：登录“交管12123”APP，通过“业务中心”进入到“申领免检标志”，进入申领免检标志业务流程。
第二步：选择需申领免检标志的机动车，对于交强险和车船税联网核查是否通过的，分别进入两个不同的业务操作流程。
第三步：
1、交强险和车船税联网核查通过情况下：确认车辆信息及填写寄送地址等信息即可完成申领。
2、交强险和车船税联网核查不通过情况下：用户需上传交强险、车船税凭证照片，然后填写寄送地址等信息即可完成申领。
法律依据:
《机动车驾驶证申领和使用规定》第七十二条
机动车驾驶人应当按照法律、行政法规的规定定期到公安机关交通管理部门接受审验。
机动车驾驶人按照本规定第六十三条、第六十四条换领机动车驾驶证时，应当接受公安机关交通管理部门的审验。
持有大型客车、重型牵引挂车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证的驾驶人，应当在每个记分周期结束后三十日内到公安机关交通管理部门接受审验。但在一个记分周期内没有记分记录的，免予本记分周期审验。
持有第三款规定以外准驾车型驾驶证的驾驶人，发生交通事故造成人员死亡承担同等以上责任未被吊销机动车驾驶证的，应当在本记分周期结束后三十日内到公安机关交通管理部门接受审验。
