耳膜穿孔司法鉴定流程为：
1.鉴定的委托。案件主办单位为鉴定委托的主体。
2.鉴定的受理。被鉴定人必须持有办案单位开具的伤情鉴定委托书、病历资料原件和复印件以及相关的辅助检查资料、本人的身份证明原件和复印件等，在规定时间由委托单位办案人陪同到指定的鉴定机构进行检验。
3.出具鉴定意见。
4.司法鉴定人的出庭作证。
法律依据:
《司法鉴定程序通则》第二条
司法鉴定程序是指司法鉴定机构和司法鉴定人进行司法鉴定活动应当遵循的方式、方法、步骤以及相关的规则和标准。
本通则适用于司法鉴定机构和司法鉴定人从事各类司法鉴定业务的活动。
《司法鉴定程序通则》第三条
本通则适用于司法鉴定机构和司法鉴定人从事各类司法鉴定业务的活动。
