机动车紧急避险的时候闯红灯算违章的，但是可以收集相关证据到交警部门说明情况，取消对驾驶人的处罚，紧急避险是指为了使国家、公共利益、本人或者他人的人身、财产和其他权利免受正在发生的危险，不得已而采取的损害另一较小的合法权益的行为。
法律依据:
《道路交通安全违法行为处理程序规定》第二十一条
交通技术监控设备记录或者录入道路交通违法信息管理系统的违法行为信息，有下列情形之一并经核实的，应当予以消除：
（一）警车、消防车、救护车、工程救险车执行紧急任务的；
（二）机动车被盗抢期间发生的；
（三）有证据证明救助危难或者紧急避险造成的；
（四）现场已被交通警察处理的；
（五）因交通信号指示不一致造成的；
（六）不符合本规定第十八条规定要求的；
（七）记录的机动车号牌信息错误的；
（八）因使用伪造、变造或者其他机动车号牌发生违法行为造成合法机动车被记录的；
（九）其他应当消除的情形。
