食品经营许可证在网上适用的办理流程包括有：登录食品药品监管局系统官网，选择食品经营许可证办理；填写相关申请信息，上传相关资料；打印申请表；提交相应材料并等待审查。
法律依据:
《食品经营许可管理办法》第四条
食品经营许可实行一地一证原则，即食品经营者在一个经营场所从事食品经营活动，应当取得一个食品经营许可证。
《食品经营许可管理办法》第五条
食品药品监督管理部门按照食品经营主体业态和经营项目的风险程度对食品经营实施分类许可。
《食品经营许可管理办法》第六条
国家食品药品监督管理总局负责监督指导全国食品经营许可管理工作。
县级以上地方食品药品监督管理部门负责本行政区域内的食品经营许可管理工作。
