涉及商标侵权的公司已经注销了，应该将被告人改为该公司之前的法定代表人或者股东。如果公司注销之后，被告还是公司，法院不会受理。因为起诉需要有确定存在的被告。
法律依据:
《中华人民共和国商标法实施条例》第七十三条
商标注册人申请注销其注册商标或者注销其商标在部分指定商品上的注册的，应当向商标局提交商标注销申请书，并交回原《商标注册证》。商标注册人申请注销其注册商标或者注销其商标在部分指定商品上的注册，经商标局核准注销的，该注册商标专用权或者该注册商标专用权在该部分指定商品上的效力自商标局收到其注销申请之日起终止。
