医院发生医疗事故的，处理流程如下：
1、医务人员报告上级领导。
2、医疗机构立即采取必要的补救措施。
3、医疗机构保护现场，即保管材料，封存现场物品。
4、医疗机构对该事故进行调查、处理，并报告上级卫生行政部门。
5、医疗机构作出处理决定，并同患者一方进行协商沟通。
6、协商不成的，患者申请调解或者进行起诉。
法律依据:
《医疗事故处理条例》第四十三条
医疗事故争议由双方当事人自行协商解决的，医疗机构应当自协商解决之日起7日内向所在地卫生行政部门作出书面报告，并附具协议书。
第三十七条
发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。
当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。
